Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Supt16hQ920B9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Supt16hQ920B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Supt16hQ920B9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Supt16hQ920B9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Supt16hQ920B9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Supt16hQ920B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms