Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Afg3l1Q920A7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afg3l1Q920A7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Afg3l1Q920A7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afg3l1Q920A7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afg3l1Q920A7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Afg3l1Q920A7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Afg3l1Q920A7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms