Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Prpf6Q91YR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prpf6Q91YR7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prpf6Q91YR7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prpf6Q91YR7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf6Q91YR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf6Q91YR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf6Q91YR7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms