Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Farp2Q91VS8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Farp2Q91VS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Farp2Q91VS8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Farp2Q91VS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Farp2Q91VS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32,57■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Farp2Q91VS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Farp2Q91VS8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32,39■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Farp2Q91VS8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32,35■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32,33■■■□□ 2,77
Farp2Q91VS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32,27■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Farp2Q91VS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,22■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32,21■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Farp2Q91VS8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32,14■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Farp2Q91VS8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32,13■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32,11■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Farp2Q91VS8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,9 ms