Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ppargc1bQ8VHJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ppargc1bQ8VHJ7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ppargc1bQ8VHJ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ppargc1bQ8VHJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms