Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,09■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22,05■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22,03■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
MpdzQ8VBX6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21,99■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
MpdzQ8VBX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,93■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21,92■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21,91■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
MpdzQ8VBX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21,88■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21,83■■□□□ 1,09
MpdzQ8VBX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,82■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21,78■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
MpdzQ8VBX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21,76■■□□□ 1,07
MpdzQ8VBX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
MpdzQ8VBX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
MpdzQ8VBX6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
MpdzQ8VBX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
MpdzQ8VBX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,8 ms