Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irak4Q8R4K2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irak4Q8R4K2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irak4Q8R4K2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irak4Q8R4K2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irak4Q8R4K2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms