Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip5Q8R361 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab11fip5Q8R361 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab11fip5Q8R361 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms