Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nudcd3Q8R1N4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nudcd3Q8R1N4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd3Q8R1N4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd3Q8R1N4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd3Q8R1N4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.9 ms