Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZW7

Gabrp, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabrpQ8QZW7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GabrpQ8QZW7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabrpQ8QZW7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GabrpQ8QZW7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GabrpQ8QZW7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms