Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J0

Dclre1c, Protein artemis, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1cQ8K4J0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1cQ8K4J0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclre1cQ8K4J0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dclre1cQ8K4J0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclre1cQ8K4J0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1cQ8K4J0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms