Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Depp1Q8K2F3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Depp1Q8K2F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Depp1Q8K2F3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Depp1Q8K2F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Depp1Q8K2F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Depp1Q8K2F3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Depp1Q8K2F3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Depp1Q8K2F3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms