Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2B0

P3h4, Endoplasmic reticulum protein SC65, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3h4Q8K2B0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3h4Q8K2B0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P3h4Q8K2B0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
P3h4Q8K2B0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P3h4Q8K2B0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P3h4Q8K2B0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P3h4Q8K2B0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P3h4Q8K2B0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P3h4Q8K2B0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P3h4Q8K2B0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P3h4Q8K2B0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms