Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gin1Q8K259 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gin1Q8K259 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gin1Q8K259 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gin1Q8K259 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gin1Q8K259 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms