Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt33aQ8K0Y2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Krt33aQ8K0Y2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt33aQ8K0Y2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33aQ8K0Y2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt33aQ8K0Y2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms