Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnma3Q8JZW8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pnma3Q8JZW8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pnma3Q8JZW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pnma3Q8JZW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pnma3Q8JZW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pnma3Q8JZW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms