Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIP4

Mark4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark4Q8CIP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mark4Q8CIP4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mark4Q8CIP4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mark4Q8CIP4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mark4Q8CIP4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mark4Q8CIP4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms