Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI52

Gramd1c, GRAM domain-containing protein 1C, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd1cQ8CI52 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gramd1cQ8CI52 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gramd1cQ8CI52 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gramd1cQ8CI52 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gramd1cQ8CI52 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gramd1cQ8CI52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gramd1cQ8CI52 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gramd1cQ8CI52 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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