Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SltmQ8CH25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SltmQ8CH25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SltmQ8CH25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SltmQ8CH25 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SltmQ8CH25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SltmQ8CH25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SltmQ8CH25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SltmQ8CH25 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SltmQ8CH25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms