Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vcpip1Q8CDG3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vcpip1Q8CDG3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vcpip1Q8CDG3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vcpip1Q8CDG3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vcpip1Q8CDG3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vcpip1Q8CDG3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms