Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apol7cQ8C6E1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apol7cQ8C6E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apol7cQ8C6E1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apol7cQ8C6E1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol7cQ8C6E1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms