Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa22Q8C1N8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa22Q8C1N8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa22Q8C1N8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa22Q8C1N8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms