Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms