Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ube3dQ8BX13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ube3dQ8BX13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ube3dQ8BX13 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ube3dQ8BX13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube3dQ8BX13 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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