Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pggt1bQ8BUY9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pggt1bQ8BUY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pggt1bQ8BUY9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pggt1bQ8BUY9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pggt1bQ8BUY9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms