Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUN5

Smad3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad3Q8BUN5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smad3Q8BUN5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smad3Q8BUN5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Smad3Q8BUN5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smad3Q8BUN5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smad3Q8BUN5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smad3Q8BUN5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smad3Q8BUN5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms