Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrp12Q8BUJ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrp12Q8BUJ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrp12Q8BUJ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lrp12Q8BUJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrp12Q8BUJ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms