Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rccd1Q8BTU7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rccd1Q8BTU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rccd1Q8BTU7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rccd1Q8BTU7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rccd1Q8BTU7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms