Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTR5

Dusp28, Dual specificity phosphatase 28, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp28Q8BTR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dusp28Q8BTR5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dusp28Q8BTR5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dusp28Q8BTR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dusp28Q8BTR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dusp28Q8BTR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms