Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTK5

Smyd4, SET and MYND domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd4Q8BTK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smyd4Q8BTK5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smyd4Q8BTK5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smyd4Q8BTK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smyd4Q8BTK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smyd4Q8BTK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd4Q8BTK5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd4Q8BTK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smyd4Q8BTK5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smyd4Q8BTK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smyd4Q8BTK5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms