Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Best2Q8BGM5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Best2Q8BGM5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Best2Q8BGM5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Best2Q8BGM5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Best2Q8BGM5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Best2Q8BGM5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Best2Q8BGM5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Best2Q8BGM5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms