Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG17

Nol12, Nucleolar protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol12Q8BG17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nol12Q8BG17 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nol12Q8BG17 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nol12Q8BG17 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nol12Q8BG17 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nol12Q8BG17 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nol12Q8BG17 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms