Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Jph4Q80WT0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Jph4Q80WT0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Jph4Q80WT0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Jph4Q80WT0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Jph4Q80WT0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Jph4Q80WT0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Jph4Q80WT0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Jph4Q80WT0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Jph4Q80WT0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Jph4Q80WT0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms