Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcsk9Q80W65 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcsk9Q80W65 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcsk9Q80W65 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcsk9Q80W65 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcsk9Q80W65 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk9Q80W65 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcsk9Q80W65 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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