Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actr5Q80US4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actr5Q80US4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actr5Q80US4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actr5Q80US4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Actr5Q80US4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Actr5Q80US4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Actr5Q80US4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Actr5Q80US4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Actr5Q80US4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actr5Q80US4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms