Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Otop3Q80UF9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Otop3Q80UF9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Otop3Q80UF9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Otop3Q80UF9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Otop3Q80UF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Otop3Q80UF9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Otop3Q80UF9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms