Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC37,91■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,9■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37,89■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC37,88■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37,88■■■■□ 3,66
Rpap1Q80TE0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37,86■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,83■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Rpap1Q80TE0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC37,82■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37,81■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37,78■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Rpap1Q80TE0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37,75■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37,72■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37,7■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37,7■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Rpap1Q80TE0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37,66■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Rpap1Q80TE0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,63■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37,61■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37,59■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,61
Rpap1Q80TE0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37,57■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37,54■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Rpap1Q80TE0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC37,5■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37,49■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37,49■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,48■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Rpap1Q80TE0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37,42■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Rpap1Q80TE0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
Rpap1Q80TE0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Rpap1Q80TE0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37,37■■■■□ 3,57
Rpap1Q80TE0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms