Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp3Q7TST5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp3Q7TST5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamp3Q7TST5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lamp3Q7TST5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lamp3Q7TST5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms