Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccp110Q7TSH4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccp110Q7TSH4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccp110Q7TSH4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccp110Q7TSH4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccp110Q7TSH4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccp110Q7TSH4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccp110Q7TSH4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccp110Q7TSH4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccp110Q7TSH4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccp110Q7TSH4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.1 ms