Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rps6ka6Q7TPS0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6ka6Q7TPS0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6ka6Q7TPS0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka6Q7TPS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rps6ka6Q7TPS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka6Q7TPS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka6Q7TPS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka6Q7TPS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms