Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Znf250Q7TNU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf250Q7TNU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf250Q7TNU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf250Q7TNU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms