Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcg2Q7TMS5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcg2Q7TMS5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Abcg2Q7TMS5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcg2Q7TMS5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcg2Q7TMS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcg2Q7TMS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcg2Q7TMS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms