Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Eci3Q78JN3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eci3Q78JN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Eci3Q78JN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eci3Q78JN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms