Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQJ5

Dna2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dna2Q6ZQJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dna2Q6ZQJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dna2Q6ZQJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dna2Q6ZQJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dna2Q6ZQJ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dna2Q6ZQJ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dna2Q6ZQJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dna2Q6ZQJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dna2Q6ZQJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dna2Q6ZQJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dna2Q6ZQJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dna2Q6ZQJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms