Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zc3h4Q6ZPZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h4Q6ZPZ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zc3h4Q6ZPZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h4Q6ZPZ3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms