Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Cxcl3Q6W5C0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cxcl3Q6W5C0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21,69■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21,68■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Cxcl3Q6W5C0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21,62■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21,59■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,59■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Cxcl3Q6W5C0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Cxcl3Q6W5C0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21,5■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Cxcl3Q6W5C0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,49■■□□□ 1,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,1 ms