Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc88cQ6VGS5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc88cQ6VGS5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc88cQ6VGS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ccdc88cQ6VGS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms