Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp8b3Q6UQ17 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp8b3Q6UQ17 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atp8b3Q6UQ17 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp8b3Q6UQ17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp8b3Q6UQ17 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp8b3Q6UQ17 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp8b3Q6UQ17 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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