Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timd4Q6U7R4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timd4Q6U7R4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timd4Q6U7R4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timd4Q6U7R4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timd4Q6U7R4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timd4Q6U7R4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timd4Q6U7R4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timd4Q6U7R4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timd4Q6U7R4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Timd4Q6U7R4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms