Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shc4Q6S5L9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shc4Q6S5L9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Shc4Q6S5L9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Shc4Q6S5L9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Shc4Q6S5L9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Shc4Q6S5L9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms