Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc82Q6PG04 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc82Q6PG04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc82Q6PG04 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc82Q6PG04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc82Q6PG04 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc82Q6PG04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc82Q6PG04 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms